穆明的死士被全部杀死之后，穆明本人被活捉，与他合作耍弄阴谋手段的相关官员吏员也被一网打尽，杀死的杀死，逮捕的逮捕。
到洪武十二年四月二十一日，整个山东范围内这一波突如其来的阴谋叛乱被全部平定，所有参与人等悉数被处置，散播谣言的人基本上被全部逮捕，就算有漏网之鱼，估计也只有小猫三两只。
苏咏霖在济南城内的胜利广场上公开审讯阴谋参与者。
从中都赶来的三司联合执法队作为主审，将全部的证据线索和事实摆列出来，以杜非的证词和某些心如死灰的人自己所承认的事情为依据，进行了非常公正的判罚。
主谋梁元凯、张茗、穆明、黄刚、杜非，全部被判处死刑。
其中梁元凯、张茗、穆明、黄刚四人因为罪行特别严重，被判处车裂之刑。
他们的家人和族人依照大明官员法，被判处没收一切财产、取消一切福利待遇、剥夺一切权利，流放库页岛为苦役，五代不得赦。
杜非因为情节特殊，虽然犯下了不可饶恕的罪行，但是有主动坦白的功劳，念及及时悔过，协助朝廷平定叛乱立下一定的功劳，遂予以特殊优待，不判车裂，改为斩首。
虽然他必须要死，但是他的家人因此得到了宽大处理，被没收财产、取消福利待遇，剥夺一切人身权利五年，判劳动改造五年。
他们将前往黄河沿线从事黄河大坝维修工作五年，之后方可得赦，回归平民身份，不必因为杜非的事情而牵连子孙数代人。
这四名主要罪犯之外的一切有官员、吏员身份的从犯罪无可赦，全部判处斩首之刑，他们的家族也将连坐，全部发配黑龙江行省库页岛服苦役，三代不得赦。
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